Modélisation en génétique des populations

Modélisation en génétique des populationsCode de l'UE : HMMA415

Présentation

L'objectif de ce cours est de présenter les concepts de base de l'inférence des processus en génétique des populations. Pour cela on présente d'abord des rappels de génétique, puis on introduit quelques processus canoniques (modèle de Wright-Fisher, modèles de structuration des population, processus mutationnels des marqueurs génétiques) et leur méthodes d'analyse mathématique (coalescence, diffusion). Les méthodes classiques d'inférence fondées sur les probabilités d'identité de paires de gènes, et les développements plus récents (algorithmes pour le calcul de la vraisemblance, approximate Bayesian computation) sont développés sur ces bases. Des thématiques complémentaires (par exemple, détection des effets de la sélection naturelle sur des marqueurs) peuvent être abordées à travers des analyses d'articles.
 

Volume horaire

  • CM : 21
  • TD : 0
  • TP : 0
Diplômes intégrant cette UE

En bref

Crédits ECTS 5

Période de l'année
S4

Contact(s)

Contact(s) administratif(s)

Benoite DE SAPORTA (benoite.de-saporta @ umontpellier.fr)