Chemoinformatique

ChemoinformatiqueCode de l'UE : HMCH302

Présentation

Les thématiques suivantes sont détaillées :

Une partie théorique dédiée à la chemoinformatique :
CHEMICAL MOLECULE
Representation and research of structures and substructures.
Similarity search (2D / 3D), clustering and diversity analysis.
Search chemical molecules, patent databases or chemical reactions.

ENERGY INTERACTIONS
Predictions / calculations, tertiary structures of molecules, homology modeling.
Molecular interactions, docking, de novo design.
(notion of energy, conformation, molecular mechanics, molecular dynamics).
Qasr 3D, ADMET.

Une partie théorique dédiée plus spécifiquement aux outils de modélisation pour le drug-design :
Structure based drug design.
Ligand based drug design.
Avec une introduction au concept du Fragment-based drug-design.

Une partie dédiée à l’aspect pratique avec un travail sur ordinateurs :
Design d’une chimiothèque virtuelle appliquée aux interactions proteine-proteine .
Cas de Arf1 et de son facteur d’échange Arno

Objectifs

L’objectif est de donner aux étudiants une expérience pratique sur postes de travail en Chemoinformatique et en modélisation moléculaire. Les limitations et les possibilités de plusieurs logiciels seront ainsi appréhendées.
Formation expérimentale : travail en monôme sur ordinateur

Pré-requis recommandés

Aucun

Volume horaire

  • CM : 6
  • TD : 18
  • TP : 0
Diplômes intégrant cette UE

En bref

Crédits ECTS 2.5

Période de l'année
S3

Langue d'enseignement
fr