UE Bioinformatique structurale

UE Bioinformatique structurale

Présentation

- Initiation au système UNIX
- Bio-Informatique Structurale
- Alignement de séquences
- Prédiction de structures
- Interface Bio-Informatique / Biologie Structurale
- Mécanique, Dynamique et Modélisation Moléculaire
- Criblage « in silico »
- Protéomique Fonctionnelle

Objectifs

Apprendre les méthodes et outils pour :
□ l'analyse comparative de séquences et structures 3D des
macromolécules biomolécules
□ la prédiction de leur structure tertiaire.
La connaissance de la structure 3D de bio-molécules isolées ou en
complexe avec d'autres partenaires moléculaires (substrats, inhibiteurs,
cofacteurs, récepteurs...) est une source précieuse d'informations pour
l'élucidation des mécanismes du vivant au niveau moléculaire. Ce type
d'information (qu'on peut obtenir par des techniques expérimentales telles
que la cristallographie ou la RMN) peut être utilement analysé par des
moyens informatiques. Elle est couramment exploitée, par exemple, dans
l'industrie pharmaceutique pour guider la conception de nouveaux
composés à but thérapeutique (modélisation de ligands assistée par
ordinateur). De même, l'analyse comparative du grand nombre de
structures et séquences actuellement disponibles dans les bases de
données publiques permet de réaliser avec de plus en plus de fiabilité des
prédictions statistiques sur des biomolécules pour lesquelles l'information expérimentale sur leurs structures n'est pas disponible

Volume horaire

  • CM : 10
  • TP : 15
Diplômes intégrant cette UE

En bref

Crédits ECTS 2

Méthode d'enseignement
En présence

Forme d'enseignement
Conférence et colloque

Type d'enseignement

  • Formation continue
  • Formation en alternance
  • Formation initiale

Contact(s)

Composante

Responsable(s)

Pierre-Antoine BONNET (pierre-antoine.bonnet @ univ-montp1.fr)

Contact(s) administratif(s)

Katia AVELLI (katia.avelli @ univ-montp1.fr)

Lieu(x)

  • Montpellier