BioInformatique 1

Le but de ce module est de fournir des compétences pour l’analyse de séquences d’ADN issues de données génomiques, allant de l’extraction des séquences de banque de données publiques jusqu’à la manipulation de ces séquences afin d’en extraire des informations pertinentes, et cela de manière automatique via l’utilisation d’une librairie Python dédiée : BioPython. 

Le programme est le suivant :

- Rappels de biologie,

- Présentation des données en biologie format,

- Banque/bases de données,

- Programmation BioPython : Seq + SeqRecord,

- Manipulation/analyse/comparaison de séquences via des scripts Python,

- Récupération de seq dans les banques de données et analyse de séquences simple (chaines de caractères) via Biopython.

Les étudiants pourront appliquer les compétences acquises à travers un projet encadré pour le développement d’un script pour automatiser l’analyse de séquences. Ce projet sera initié durant les séances TP.