Structure de formation
Faculté des Sciences
Programme
Ressources pour l'enseignement des SVT
4 créditsApprofondissement des notions en géologie
3 créditsEcologie évolutive
4 créditsBases génétiques de l'évolution
4 créditsGéologie des bassins sédimentaires
4 créditsMicroorganismes
4 créditsPhysiologie Animale 2
4 créditsDiversité et évolution des métazoaires actuels et passés N3
4 créditsAnglais S5
2 crédits
Stage et didactique
5 crédits40hDynamique de la Terre solide
4 créditsDiversité et phylogénie des Angiospermes
4 créditsSciences et Société: histoire des sciences, éthique, esprit
4 créditsApprofondissement des notions en biologie
Approfondissement biologie 1
2 créditsApprofondissement biologie 2
2 crédits
Météorologie, climatologie et cycle de l'eau
2 créditsPaléoécologie et biostratigraphie
4 créditsEcole de terrain pluri-disciplinaire en biologie et en géo
5 crédits
Ressources pour l'enseignement des SVT
ECTS
4 crédits
Composante
Faculté des Sciences
Approfondissement des notions en géologie
ECTS
3 crédits
Composante
Faculté des Sciences
Ecologie évolutive
ECTS
4 crédits
Composante
Faculté des Sciences
Cette UE prolonge l'UE Base de l'évolution pour introduire les principaux concepts en écologie évolutive afin de comprendre et formaliser de façon simple les mécanismes évolutifs et écologiques qui façonnent la biodiversité à différentes échelles d'intégration.
Cette UE est conçue comme un ensemble cohérent où cours, TD et TP sont complémentaires. Les notions sont abordées par l’exemple puis formalisées à l’aide de modèles mathématiques, lesquels sont confrontés à l’expérience et à des données réelles.
Elle traitera de dynamique des populations (compétition intra- et interspécifique), de niche écologique et détaillera les mécanismes de l'évolution et leurs conséquences génétiques à l'échelle des populations: sélection naturelle (dont sélection sexuelle), influence des régimes de reproduction, dérive génétique. Les TD permettront aux étudiants de s'approprier la formalisation mathématique de notions vues en cours et leur modélisation informatique simple ainsi que des analyses de jeux de données. Les TP permettront la réalisation et l'analyse en groupes restreints de 2 expériences d'1 mois chacune (avec rédaction d'un rapport et présentation à l'oral) afin de développer la méthodologie et le raisonnement scientifique.
Bases génétiques de l'évolution
ECTS
4 crédits
Composante
Faculté des Sciences
L’UE est organisé en cinq grands thèmes :
Thème 1 : Cartographie génétique et recombinaison. Notions de biologie moléculaire lié à l’expression des gènes, la réparation de l’ADN et les processus épigénétique.
Thème 2 : Introduction à l’évolution moléculaire : Mesure de l’intensité de la sélection dans la divergence génétique. Horloge moléculaire et variation des taux d’évolution crée par l’action de la selection naturelle. Théorie neutraliste de l’évolution.
Thème 3: Introduction à la génomique : composition et taille des génomes. Importance des éléments répétées. Notion de liaison génétique et d’effet local de la sélection. Influence de la démographie.
Thème 4 : Outils moléculaires pour la biodiversité : Barcoding, eDNA, metabarcoding. Taxonomie moléculaire. Les limites liés à l’hybridation. Les applications en conservation.
Thème 5 : Hérédité extranucléaire. Symbiose, parasitisme et co-evolution (intra-cellulaire : p.ex. Wolbachia). Notion de phénotype étendue.
Géologie des bassins sédimentaires
ECTS
4 crédits
Composante
Faculté des Sciences
Genèse, nature et devenir des dépôts dans les bassins sédimentaires.
Cycle de 15 cours / conférences/ débat et TP/TD
Contenu des Cours / TP / TD intégrés, (les bassins sédimentaires, l'altération des continents,
le transport du sédiment, les environnements détritiques et carbonatés, les facteurs qui agissent sur la sédimentation : Stratigraphie séquentielle, la diagenèse)
Microorganismes
ECTS
4 crédits
Composante
Faculté des Sciences
Cette unité d'enseignement visera à aborder les éléments nécessaires à la compréhension du mode de vie des grands groupes d'organismes unicellulaires à la base du fonctionnement des écosystèmes (virus, bactéries, archées, et eucaryotes unicellulaires....). Les cours permettent d'aborder l'organisation biologique de chaque type d'organisme, les modalités de reproduction, la diversité, pour aboutir à des notions d'écologie. Nous aborderons le rôle de ces microorganismes dans le fonctionnement et la dynamique des écosystèmes, en considérant les interactions que ces organismes entretiennent avec les autres êtres vivants ( notion de « symbiose » dans toutes ses déclinaisons).
Les travaux pratiques permettront :
- la mise en œuvre de techniques permettant le dénombrement bactérien (CFU), l’identification d’une souche particulière à partir d’un échantillon de l’environnement
- la mise en évidence de la diversité du phytoplancton (algues unicellulaires) en milieu aquatique (eau douce)
- la mise en évidence de la spécificité d’interactions entre bactéries et bactériophages
Physiologie Animale 2
ECTS
4 crédits
Composante
Faculté des Sciences
Diversité et évolution des métazoaires actuels et passés N3
ECTS
4 crédits
Composante
Faculté des Sciences
L’objectif majeur consiste à apprendre les bases de l’anatomie comparée des chordés, de manière à pouvoir les comparer et les classer, avant d’en retracer les étapes-clés de l’histoire évolutive. Les enseignements sont intégratifs en ce sens qu’ils font appel à la fois aux organismes actuels et au registre fossile, de manière à documenter l’histoire évolutive du clade dans son intégralité et sous tous ses aspects. Les approches anatomiques, biomécaniques, phylogénétiques, et écomorphologiques seront abordés en CM afin d’illustrer la diversité et les grandes caractéristiques des chordés. Les TPs (et TDs) permettront d’illustrer l’évolution de la diversité des téguments, du squelette, de la musculature, du système digestif et respiratoire sur de longues échelles de temps.
Anglais S5
ECTS
2 crédits
Composante
Faculté des Sciences
Stage et didactique
ECTS
5 crédits
Composante
Faculté d’éducation
Volume horaire
40h
Dynamique de la Terre solide
ECTS
4 crédits
Composante
Faculté des Sciences
Diversité et phylogénie des Angiospermes
ECTS
4 crédits
Composante
Faculté des Sciences
L’UE a pour objectif de proposer un panorama de la diversité des Angiospermes, approchée à la fois au travers du prisme des phylogénies les plus récentes proposées par l’Angiosperm Phylogeny Group (APG). Cette trame phylogénétique sera étayée tout au long de l’UE par l’observation concrète des caractères végétatifs et floraux d’une sélection de taxons répartis sur l’ensemble de la phylogénie, de façon à dégager les synapomorphies des principaux clades, les éventuelles homoplasies, ainsi que les adaptations (biologie florale, pollinisation, interactions trophiques, etc.)
Les étudiants appréhendent également la diversité des Angiospermes sous l’angle floristique, par la réalisation d’un herbier d’espèces en général méditerranéennes. Ils se familiarisent à cette occasion avec l’utilisation d’une flore et des outils numériques d’aide à la détermination (Pl@ntNet e-Flore de Tela Botanica, etc.).
Sciences et Société: histoire des sciences, éthique, esprit
ECTS
4 crédits
Composante
Faculté des Sciences
Approfondissement des notions en biologie
Composante
Faculté des Sciences
Approfondissement biologie 1
ECTS
2 crédits
Composante
Faculté des Sciences
Approfondissement biologie 2
ECTS
2 crédits
Composante
Faculté des Sciences
Météorologie, climatologie et cycle de l'eau
ECTS
2 crédits
Composante
Faculté des Sciences
- différence météo/climat
- structure de l’atmosphère, bilan radiatif, effet de serre, circulation des vents, dépressions/anticyclones, cyclones tropicaux, tornades
- circulation océanique générale (Munk, courants principaux, Conveyor Belt)
- distribution géographique et définition des climats
- changement climatique actuel
- cycle de l'eau global, bilan hydrologique, bilan hydrique, bilan d'énergie au-dessus d'une parcelle cultivée pour estimer l'évapotranspiration
Paléoécologie et biostratigraphie
ECTS
4 crédits
Composante
Faculté des Sciences
Ecole de terrain pluri-disciplinaire en biologie et en géo
ECTS
5 crédits
Composante
Faculté des Sciences